De genética

Tras varios días cacharreando con la tabla del artículo de  Schaker y Seimetz, y la propia información de ClinicalTrials.gov, comparto la observación de que PD-1  y CCR-5 son los objetivos más deseados en los CT de edición génica. Nueve CT´S tienen por objetivo el gen PD-1. NCT Number Title NCT03747965 Study of PD-1 Gene-knocked Out Mesothelin-directed CAR-T Cells With the Conditioning of PC in Mesothelin Positive Multiple Solid Tumors NCT03399448 NY-ESO-1-redirected CRISPR (TCRendo and PD1) Edited T Cells (NYCE T Cells) NCT03081715 PD-1 Knockout Engineered T Cells for Advanced Esophageal Cancer NCT02793856 PD-1 Knockout Engineered T Cells for Metastatic Non-small Cell Lung Cancer NCT02863913 PD-1 Knockout Engineered T Cells for Muscle-invasive Bladder Cancer NCT02867332 PD-1 Knockout Engineered T Cells for Metastatic Renal Cell Carcinoma. NCT02867345 PD-1 Knockout Engi...

Dando vueltas a los datos  de los ensayos clínicos de edición génica obtenidos de la página web de clínicaltrials.gov tras conocer del trabajo de Schacker entiendo que son las siguientes variables, las que definen las diversas soluciones que se vienen ensayando: Enfermedad a tratar, Target (gen a modificar, eliminar, incorporar al genoma del paciente), procedimiento de modificación del genoma (Modification),  nucleasa utilizada,  procedimiento de entrega (delivery),  tipo (In-vivo, ex-vivo). Con relación a la enfermedad a tratar, son 21 diferentes las listadas por Sacher, que se han agrupado en 6 grupos para facilitar su tabulación, y que son los siguientes: Cáncer hemático:  Acute myeloid leukemia, B cell leukemia, B cell lymphoma y T cell Acute Lymphoblastic Leukemia, T cell Acute Lymphoblastic Lymphoma, T-non-Hodgkin Lymphoma Cáncer no hemático:  EBV positive advanced stage malignancies; Esophageal cancer; Hormone Refractor...

Tirando del hilo de las tablas de CT´s  de edición génica he llegado a un interesante artículo de Cory Renauer: Better Buy: CRISPR Therapeutics vs. Sangamo Therapeutics  en el que se plantea qué es mejor, comprar acciones de una empresa o de la otra. Sangamo Tx es el mayor esponsor de CT´s de edición génica recogidos en la tabla de Schacker (n= 8 , 7) y CRISPR Tx comparte con Vertex la esponsorización de otros dos CT´s. La primera empresa es una veterana con sus casi 35 años y la segunda es mucho más joven con 7 años de vida. En dos tablas, una referida a la empresa y otra a los productos, las comparo para ver qué compraríamos. Sangamo Therapeutics CRISPR Therapeutics Creación 1995 2013 Valor en bolsa (6/1/2020). Ver abajo trayectoria bursátil $ 954 million $ 3566,65 million Popes Carpentier Oficinas centrales :  7000 Marina Blvd, Brisbane, CA 94005, EE. UU. Baarerstrasse 14 ZUG V8 CH-6300 Switzerlan...

Tras publicar la entrada anterior  y dos entradas atrás   sobre CRISPR, y en el camino de entender la dimensión de las posibilidades de esta herramienta, he encontrado una interesante iniciativa, que entre otras cosas tiene un repositorio de plásmidos: Addgene We distribute 81,207 plasmids on behalf of 4,062 labs from around the world. We also produce 446 ready-to-use viral vectors from our plasmid collection. Find what you need for your next experiment He bajado su eBook   Addgene's eBook: CRISPR 101  en el que se habla de numerosas herramientas de edición génica que están siendo, no sé si descubiertas ó inventadas, para muy diversos usos: Cpf1 family members contain a RuvC-like endonuclease domain, but they lack Cas9’s second HNH endonuclease domain. Cpf1 cleaves DNA in a staggered pattern and requires only one RNA rather than the two (tracrRNA and crRNA) needed by Cas9 for cleavage.  En la línea de disminuir los off-ta...